MTs Negeri 3 Boyolali merupakan salah satu Madrasah Tsanawiyah Negeri yang ada di Kabupaten Boyolali, Provinsi Jawa Tengah. MTsN 3 Boyolali menerima peserta didik baru untuk pertama kalinya pada tahun pelajaran 1978/1979. Dengan lokasi madrasah di Jalan Kemuning No.35 Sidoharjo Kelurahan Banaran, Kec. Boyolali, Kabupaten Boyolali. MTsN 3 Boyolali memiliki karakteristik disiplin, berprestasi, terampil, berbudaya lingkungan, dan berprilaku keislaman. Saat ini jumlah rombel belajar di MTsN 3 Boyolali ada 29 rombel. Rombel tersebut terdiri dari kelas VII ada 9 rombel, kelas VIII ada 10 rombel, dan kelas IX ada 10 rombel. Dari masing-masing rombel per tingkatan, 2 rombel diisi oleh kelas Program Khusus (PK).
